A epistasia é um tipo de interação gênica na qual um par de alelos inibe a manifestação de outros pares. Os genes inibidores são chamados de epistáticos e os inibidos de hipostáticos. A cor do pelo de camundongos é influenciada por vários pares de alelos. De forma simplificada, o alelo dominante A fornece o padrão aguti, no qual o pelo é preto com uma faixa amarela, o que dá uma tonalidade marrom acinzentada . O alelo a determina pelo preto uniforme. A presença de um alelo de outro gene , C, é uma condição dispensável para que se forme qualquer pigmento. Em dose dupla, o alelo c é epistático sobre A e a , e forma-se pelo albino. Assim, os animais aacc e A_CC são albinos. Com essas informações, podemos montar um quadro com os fenótipos e os genótipos possíveis. Cruzando dois indivíduos homozigotos e, depois, indivíduos duplo heterozigotos, obtêm-se em F2 uma proporção de 9:3:4. A epistasia ocorre quando dois ou mais pares de alelos diferentes influenciam a produção de enzimas que atuam em diferentes etapas de uma sequência de reações químicas, em que uma substancia inicial é transformada em outras até originar um produto responsável (em interação com o ambiente) por uma característica. Nas interações não epistáticas, os genes atuam em diferentes sequências de reações, e os produtos de cada sequência podem interagir e originar diferentes fenótipos. a epistasia dominante ocorre quando um alelo dominante impede o efeito de um alelo de outro gene. Um exemplo de epistasia dominante é o que acontece com a cor das penas em certas raças de galinhas. Um alelo epistático I inibe a manifestação de um alelo de outro par, situado em outro cromossomos, o alelo C, responsável pela produção da cor. O alelo I não tem efeito inibitório e o alelo C não produz a cor.
